2024年诺贝尔化学奖
2024年诺贝尔化学奖官方获奖图
当地时间10月9日,瑞典皇家科学院宣布,将2024年诺贝尔化学奖授予大卫·贝克(David Baker)、戴米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)和约翰·江珀(John M.Jumper),以表彰他们在蛋白质设计和蛋白质结构预测领域作出的贡献。3名获奖者共获得1100万瑞典克朗(约合745万元人民币)奖金。
德米斯·哈萨比斯和约翰·詹珀成功地利用人工智能技术预测了几乎所有已知蛋白质的结构。而大卫·贝克掌握了生命的构建模块,并创造了全新的蛋白质。
戴密斯·哈萨比斯 (Demis Hassabis)
哈萨比斯早就享誉国际科技圈。出生于1976年,在伦敦长大,母亲是新加坡华人。4岁开始下国际象棋,有“国际象棋神童”的美誉,8岁自学编程,13岁时达到了大师标准。本科以计算机科学双一的成绩毕业于剑桥大学,后来在伦敦大学学院完成了认知神经科学博士学位,又在MIT和哈佛攻读博士后。
2010年,他与在伦敦大学学院读博士遇到的施恩·莱格(Shane Legg)共同创办了DeepMind并担任CEO。2014年,DeepMind被Google收购,在Alphabet旗下独立运营。2023年,DeepMind与“谷歌大脑”合并,Hassabis升任合并后的Google DeepMind团队CEO。
约翰·乔普(John Jumper)
DeepMind Technologies高级研究科学家,AlphaFold的第一作者。他在芝加哥大学获得博士学位,主要研究方向是使用ML来模拟蛋白质折叠和动力学。2021年,他被Nature列为年度榜单中的十大“重要人物”之一。
戴维·贝克(David Baker)
1962年出生于美国华盛顿州西雅图,现为华盛顿大学蛋白质设计研究所所长。他因开发从头设计自然界从未出现的新型蛋白的技术,获得2020年科学突破奖生命科学奖,并首次使用生成式人工智能从头设计出了全新的抗体,有望让AI从头设计蛋白进入抗体药物市场,堪称蛋白质设计领域“鼻祖级”人物,比DeepMind更早提出了预测和设计蛋白质三维结构的方法,甚至设计出了一款比AlphaFold更早的蛋白结构设计算法——RoseTTAFold。
为什么是蛋白折叠?
作为支撑人体基本生命活动的物质,蛋白质由20种氨基酸呈念珠状连接形成三维形状,而形状本身决定了蛋白质的功能,所以研究蛋白质形状一直是医学领域的热门方向。
在 AlphaFold 出现之前,这都需要通过实验来完成的。让蛋白质结晶是件非常困难的事情,有些蛋白质不能像膜蛋白那样结晶,必须使用昂贵的电子显微镜或X射线晶体分析仪,耗费数月、甚至几年,才能得到三维结构并将其结构可视化。无数博士都在研究单一蛋白质的折叠。
而AlphaFold2 能够直接从蛋白质的氨基酸序列中预测蛋白质的3D结构,并且达到原子级精度,被认为解决了困扰人类50年历史的蛋白质折叠挑战,迅速推进了人类对基本生物过程的理解,并促进药物设计。
2018年,DeepMind官宣了旗下初代AlphaFold,它在第13届“蛋白质结构预测奥运会”CASP比赛中,成功预测了43种蛋白质中25种蛋白质的最准确结构,力压其他97个参赛者。
2020年,DeepMind又祭出了AlphaFold2。它能够在广泛领域进行蛋白质结构的预测,已经将两亿多蛋白的三维结构全部都预测出来,在结构生物学中是最重要的里程碑的贡献,对后续蛋白质结构及功能研究具有开创性意义,特别是对生物制药的促进作用巨大。之后的AlphaFold-Multimer 又推动了对蛋白质-蛋白质复合物的预测。
2024年5月,由 Google DeepMind 和 Isomorphic Labs 研究团队推出的新一代 AlphaFold—— AlphaFold 3登上了 Nature。AlphaFold 3 成功预测了所有生命分子(蛋白质、DNA、RNA、配体等)的结构和相互作用。与现有的预测方法相比,AlphaFold 3 发现蛋白质与其他分子类型的相互作用至少提高了 50%,对于一些重要的相互作用类别,预测准确率甚至提高了一倍。